從動植物油脂生產(chǎn)的柴油稱為生物柴油（Biodiesel），它是一種長鏈脂肪酸的單烷基酯，在工業(yè)應(yīng)用上主要指脂肪酸甲酯。天然油脂多由直鏈脂肪酸的甘油三酯組成，與甲醇酯交換后生成C12～C24的脂肪酸甲酯，分子量與柴油的接近，具有接近于柴油的性能，因此也可用在柴油機中。
    從動植物油生產(chǎn)的生物柴油不含硫和芳烴，十六烷值高，并且潤滑性能好，是一種優(yōu)質(zhì)清潔柴油。同時，這些長鏈脂肪酸單烷基酯可生物降解，高閃點，無毒，可揮發(fā)性有機物（VOCs）含量低，具有優(yōu)良的潤滑性能和溶解性，所以也是制造可生物降解高附加值精細(xì)化工產(chǎn)品的原料。生物柴油的生產(chǎn)原料來源廣泛，包括最常見的植物油，如大豆油、棉籽油、棕櫚油、花生油、菜籽油、葵花籽油、紅花油、椰籽油等，以及動物油脂和餐飲廢油。低碳醇通常采用甲醇，因為其價格最為低廉。
    上述生物柴油的定義是人們所熟知的，目前用的主要是脂肪酸甲酯。除此之外，根據(jù)美國生物柴油協(xié)會的定義，生物柴油還指從油脂制備的非酯類柴油，比如加氫制備的烷烴柴油。
    從纖維素生物質(zhì)經(jīng)過高溫裂解/液化，制備的燃料屬于生物油，不是生物柴油；纖維素生物質(zhì)氣化制備出合成氣，再通過FT合成制備的燃料是BTL燃料，有些專家把由其制備的柴油看作是第二代生物柴油。